Charles Rane, un terroriste, est appréhendé par le FBI, qui le transfère à bord d'un avion de ligne. Mais des complices de Rane ont pris place dans le même appareil et ils ne tardent pas à prendre les passagers en otage.
Deux inconnus n'ayant aucun lien se retrouvent traqués par les autorités et contraints d'obéir à une mystérieuse femme qui les contacte par téléphone.
Dans ce nouveau volet, Batman augmente les mises dans sa guerre contre le crime. Avec l'appui du lieutenant de police Jim Gordon et du procureur de Gotham, Harvey Dent, Batman vise à éradiquer le crime organisé qui gangrène la ville. Leur association est très efficace mais elle sera bientôt bouleversée par le chaos déclenché par un criminel extraordinaire que les citoyens de Gotham connaissent sous le nom de Joker. Un opus violent et crépusculaire, dans lequel la performance de Heath Ledger lui vaudra un Oscar.
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