Anna, douze ans, souffre d'asthme. Elle est envoyée pour l'été à la campagne. En explorant les environs, elle découvre une maison abandonnée au milieu d'un marais, et dans cette maison, Marnie, une étrange jeune fille...
À la suite du divorce de ses parents, Rikako, lycéenne originaire de Tokyo, suit à regret sa mère, qui va s'installer à Kōchi, une ville située sur l'île de Shikoku. C'est le milieu de l'année scolaire, et l'adolescente peine à s'intégrer.
Deux lycéennes, Nozomi et Mizore, jouent ensemble dans l'orchestre de leur école. Si Nozomi est extravertie et populaire, Mizore est beaucoup plus discrète. La jeune fille craint que la fin de l'année ne signe la fin de leur amitié. Alors qu'elles travaillent ensemble sur un morceau tiré de 'Liz et l'oiseau bleu', les jeunes filles croient y voir le reflet de leur amitié.
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