Les inspecteurs Mike Lowrey et Marcus Burnett sont connus pour être l'équipe la plus efficace, mais aussi la plus turbulente, de la brigade des narcotiques de Miami. Ils enquêtent sur un trafiquant de drogue cubain qui inonde la ville d'ecstasy...
Les Machines préparent leur assaut contre Zion, dernier bastion de l'humanité. À l'intérieur de la forteresse, la résistance s'organise, mobilisant tout le monde. Pendant ce temps, dans le monde virtuel, l'agent Smith s'attaque à l'Oracle...
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