Lors d'une escale à Brest, le marin Querelle séduit tous ceux qu'il vient à croiser. De proche en proche, il fascine toute une nébuleuse interlope qui fréquente le plus grand bouge de la ville. Il va même jusqu'à charmer la maîtresse de son propre frère.
Pendant la seconde guerre mondiale, plusieurs sous-marins allemands, dont le U-96, quitte La Rochelle pour une mission qui va se transformer en cauchemar.
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