À la suite du divorce de ses parents, Rikako, lycéenne originaire de Tokyo, suit à regret sa mère, qui va s'installer à Kōchi, une ville située sur l'île de Shikoku. C'est le milieu de l'année scolaire, et l'adolescente peine à s'intégrer.
Sur l’île d’Amami, les habitants vivent en harmonie avec la nature, ils pensent qu’un dieu habite chaque arbre, chaque pierre et chaque plante. Un soir d'été, Kaito découvre le corps d’un homme flottant dans la mer, sa jeune amie Kyoko va l’aider à percer ce mystère. Ensemble, ils apprennent à devenir adultes et découvrent les cycles de la vie, de la mort et de l’amour...
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