Michael Jennings est concepteur de logiciels informatiques très sophistiqués pour des entreprises de haute technologie. Une fois son travail terminé, contre une importante somme d'argent, sa mémoire est effacée afin qu'il ne divulgue aucune information.
Dans un futur proche, le Major, une humaine sauvée d’un terrible accident, utilise ses capacités cybernétiques pour lutter contre les plus dangereux criminels. Mais un jour, elle découvre qu’on lui a menti : sa vie n’a pas été sauvée, on la lui a volée...
Dans un futur proche, un jeune programmeur, Thomas Anderson, mène une vie routinière entre son travail «officiel», plutôt assommant, et ses activités nocturnes de pirate informatique, qu'il mène sous le pseudonyme de Neo. Un jour, un certain Morpheus le contacte, l'invitant à aller au-delà des apparences pour découvrir «la Matrice»...
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