Au milieu du XVIème siècle, Zénon, alchimiste et écrivain, revient clandestinement à Bruges où ses idées déplaisent à l'Inquisition. Grâce à des protecteurs, dont le Prieur des Cordeliers, Zénon parvient à ouvrir une clinique pour les pauvres et à y exercer la médecine. Mais, son protecteur est mourant...
Au XVIème siècle dans les Cévennes, le marchand de chevaux Michael Kohlhaas mène une vie familiale heureuse. Victime de l'injustice d'un seigneur, cet homme pieux et intègre lève une armée et met le pays à feu et à sang pour rétablir son droit.
Veniamin, un adolescent beau et charismatique, devient un chrétien radical. Sa foi est folle et fait peur. A grands renforts de citations de la Bible, apprises par cœur, et hurlées à ceux qui tentent de le raisonner, il condamne les faibles, les lâches, les tièdes. Seule Elena, son professeur de biologie, tentera de le provoquer sur son propre terrain.
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