Japon, 1964. Umi est une jeune lycéenne studieuse qui a perdu son père durant la guerre de Corée. Un jour, elle fait la rencontre de Shun, l'auteur de plusieurs poèmes faisant référence aux pavillons qu'Umi dresse tous les jours en souvenir de son père.
Quand des pingouins apparaissent partout dans sa petite ville, semant au passage une joyeuse pagaille, le jeune Aoyama se dit qu’il y a là une enquête à mener. Ce studieux élève de CM1, accompagné de son meilleur ami, enrôle également sa rivale aux échecs et une énigmatique assistante dentaire pour percer le secret des pingouins.
La vie de Kun est bouleversée par l'arrivée de sa petite sœur, Miraï. Jaloux de ce bébé qui monopolise l'attention de ses parents, le petit garçon se réfugie souvent au fond du jardin. Là, il découvre un monde fantastique dans lequel il peut voyager et rencontrer ses proches à différents âges de leurs vies. À travers ces aventures, Kun découvre sa propre histoire...
Okko, une petite fille pleine de vie, habite avec sa grand-mère dans l'auberge familiale. Destinée à reprendre l'enseigne lorsqu'elle sera grande, Okko apprend doucement son futur travail, lorsqu'elle n'est pas à l'école ou en train de jouer avec d'étranges mais sympathiques fantômes.
Gamba, un rat des villes, part à l’aventure pour découvrir l’océan. En chemin, il rencontre une jeune souris qui lui raconte que sa famille et d’autres souris d’une île voisine ont été tuées par des belettes, menées par le terrifiant Noroi. Gamba, avec ses amis, promet de sauver l’île et de vaincre le maléfique Noroi et son clan…
Après le décès de son mari, Ikuko, la mère de Momo, décide de quitter Tokyo avec sa fille pour rejoindre son île natale. La maison de famille n’a pas changé depuis des années, pour la plus grande joie d’Ikuko, mais pour Momo ce décor est propice à l’ennui. Très vite, pourtant, des créatures étranges vont bouleverser le quotidien de la jeune fille.
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