Shaun le mouton voit un vaisseau spatial s'écraser dans son pré. À son bord, une extraterrestre. Quand une organisation gouvernementale la repère et veut la capturer, Shaun et le troupeau décident de la protéger...
Alors qu'il voyage dans l'espace avec ses parents, Willy est content de revenir sur Terre où il va retrouver ses amis. Quand le vaisseau spatial traverse une nuée d'astéroïdes, ses parents lui ordonnent de s'échapper avec la capsule de secours. Willy finit par atterrir sur une planète inconnue...
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