A Stockholm, le journaliste Mikael Blomkvist vient de perdre un procès pour diffamation. Sa réputation ruinée, il renonce à sa place de rédacteur en chef d'un magazine, tandis qu'un ancien industriel lui demande d'enquêter sur la disparition de sa nièce..
Depuis cinq ans, Briksburg vit dans une atmosphère post-apocalyptique dans laquelle Lucy se morfond. C'est alors que des envahisseurs Duplo — tout droit venus de l'espace — viennent perturber ce bel équilibre. Sur leur passage, ils enlèvent Lucy. Emmet est bien décidé à la sauver des aliens...
Alors que se prépare une exposition consacrée à la célèbre photographe Isabelle Reed trois ans après sa mort accidentelle, son mari et ses deux fils sont amenés à se réunir dans la maison familiale et évoquer ensemble les fantômes du passé…
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