Alors que l'hiver s'installe, P.A. voit le monde changer autour de lui et commence à observer d'étranges phénomènes dans l'environnement. Imperceptibles au début, mais petit à petit, tout son monde semble être au bord du gouffre.
Brewster McCloud, considéré comme un étrange jeune homme, veut voler. Pour ce faire, il a élu domicile dans l'Astrodome, un abri antiaerien désaffecté à Houston. Mais Brewster a beaucoup d'ennemis et la police les retrouve bientôt morts, le visage mystérieusement recouvert d'une matière qui ressemble à de la fiente d'oiseau.
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