Protégés par un arbre à voeux sacré, tous les animaux vivent en paix dans la Cité Sanctuaire. Kerry, une jeune opossum, remet en cause cet équilibre fragile en soumettant un voeu égoïste à l'arbre. En conséquence, toute la cité devient gelée...
Réputée pour son fort caractère, Maggie élève seule ses enfants depuis la disparition de son mari. Après avoir sauvé, à contre-cœur, un héros d'une catastrophe, Maggie devient involontairement la nouvelle héroïne de sa ville : Combat Wombat.
Depuis cinq ans, Briksburg vit dans une atmosphère post-apocalyptique dans laquelle Lucy se morfond. C'est alors que des envahisseurs Duplo — tout droit venus de l'espace — viennent perturber ce bel équilibre. Sur leur passage, ils enlèvent Lucy. Emmet est bien décidé à la sauver des aliens...
Long John Silver apprend que son rival, le capitaine Mendoza, a attaqué un navire anglais, au bord duquel se trouvait son jeune ami Jim Hawkins. Il part aussitôt à sa rescousse, avec en plus l'espoir de récupérer un nouveau trésor.
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