Lena, biologiste et ancienne militaire, participe à une mission destinée à comprendre ce qui est arrivé à son mari. Ils découvrent que paysages et créatures ont subi des mutations. Malgré la beauté des lieux, le danger règne et menace leur vie.
Koro est un être tout-puissant et mystérieux. Il devient enseignant de la classe 3-E de l’école secondaire de Kunugigaoka après avoir détruit la Lune et promis de faire exploser la Terre au mois de mars. Afin d’empêcher ce désastre, les élèves de troisième année deviennent des assassins. Unis par ce lien étrange, ils ont un an, jusqu’à l’obtention de leur diplôme, pour compléter leur mission.
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