Le célèbre Enterprise sert désormais de vaisseau d'entraînement pour les élèves pilotes. Les cours y sont dispensés par le capitaine Spock, l'un des chefs militaires de la Fédération des planètes unies. Envoyé en mission de routine avec Kirk, il croise la route de son vieil ennemi, Khan...
En 2019, un groupe de "répliquants", androïdes-esclaves chargés des tâches ingrates dans les colonies spatiales humaines, massacrent des êtres humains et s'enfuient d'une colonie à bord d'un vaisseau. Quatre d'entre eux parviennent sur Terre et s'introduisent dans Los Angeles. Un agent d'une unité spéciale, un "blade-runner", est chargé de les éliminer...
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