À la demande de son père, Coline retourne dans sa chambre d'enfant faire le tri dans ses affaires. Ce travail lui rappelle certains souvenirs douloureux.
Japon, 1964. Umi est une jeune lycéenne studieuse qui a perdu son père durant la guerre de Corée. Un jour, elle fait la rencontre de Shun, l'auteur de plusieurs poèmes faisant référence aux pavillons qu'Umi dresse tous les jours en souvenir de son père.
Anna, douze ans, souffre d'asthme. Elle est envoyée pour l'été à la campagne. En explorant les environs, elle découvre une maison abandonnée au milieu d'un marais, et dans cette maison, Marnie, une étrange jeune fille...
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