Un mystérieux cylindre se dirige à grande vitesse vers la Terre. L'engin, encore à distance, envoie une sonde qui vient se positionner en orbite autour de la planète bleue. Spock comprend que le cylindre tente d'entrer en contact avec des baleines à bosse, une espèce disparue au XXIIIe siècle...
Un prêtre, des étudiants et quelques scientifiques entreprennent de mettre à jour le secret contenu dans un mystérieux coffret gardé depuis des siècles par une secte religieuse.
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