Au cours d'une plongée, une spécialiste de la faune sous-marine est attaquée par une orque. Pour la sauver, un marin tue l'animal déclenchant la colère du mâle.
Les Bouchetrous, des petites créatures particulières, passent leur vie à s'amuser et à prendre du bon temps. Ces êtres sympathiques résident sur une île perdue depuis des millions d'années. Des humains viennent perturber leur quiétude...
Toute sa vie, le petit poisson Alex a rêvé de devenir un super-héros. Il saisit sa chance quand le récif de corail près de chez lui est envahi par une mystérieuse substance visqueuse noire. Avec ses amis, il décide de mener l'enquête pour sauver leur maison.
Il y a Lila, au corps couvert de poils en raison d'une maladie hormonale rare ; Nathan, monomaniaque qui pense pouvoir sauver le monde en apprenant les bonnes manières à des souris ; et Gabrielle... aussi parfaite qu'elle en a l'air ? Trois scientifiques qui s'intéressent de près à un homme sauvage, ayant grandi seul, dans la forêt... Premier long au poil du bricoleur-auteur Gondry.
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