Tout est normal sur la Planète 51. Le ciel est bleu, les habitants sont vert pomme et les Cadillacs volent. Lorsque Chuck, un astronaute aussi futé qu'une huître, y déboule avec sa fusée, les habitants s'enfuient en hurlant.
Shaun le mouton voit un vaisseau spatial s'écraser dans son pré. À son bord, une extraterrestre. Quand une organisation gouvernementale la repère et veut la capturer, Shaun et le troupeau décident de la protéger...
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