Dans la banlieue de Tokyo, sous le plancher d'une vieille maison, vivent Arrietty et sa famille, des êtres minuscules appelés les Chapardeurs. Ils se cachent des humains, volent en petite quantité le nécessaire, et se méfient des chats et des rats.
Des ninjas des quatre grands villages disparaissent. Seul le Pays du Feu semble épargné. La tension monte entre les villages, et la guerre menace d'éclater. Kakashi disparaît à son tour. Naruto et ses amis tentent de le retrouver...
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