Au collège Joséphine Baker de Saint-Ouen, en Seine-Saint Denis, Alice et Isabelle enseignent à la même classe. "Tempête sous un crâne" nous plonge le temps d’une année scolaire au cœur de ce collège tenu par une équipe énergique et soudée, dans ses couloirs et dans ses classes où les deux professeures sont bien déterminées à transmettre à leurs élèves les moyens de s’exprimer.
En Novembre 1973, un professeur confie à une famille un chimpanzé. Il s'agit de prouver que l'animal est capable d'apprendre à communiquer par le langage s'il est élevé dans un environnement humain. Le primate est censé être initié à la langue des signes, puis acquérir des rudiments de vocabulaire et de grammaire lui permettant de faire part de ses réflexions et de ses émotions.
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