Depuis toujours, Edward a fait de sa vie une suite de récits fantastiques, et Will, son fils, est incapable de savoir qui est vraiment son père. Quelque temps plus tard, Will est appelé d'urgence au chevet de son père, mourant.
Mary Lennox, une Anglaise de 10 ans, perd ses parents, victimes d'un tremblement de terre. Elle est recueillie par son oncle dans un sombre manoir. Depuis la mort de sa femme, celui-ci abandonne à sa gouvernante tout le soin de la maisonnée. Mary explore l'immense domaine et découvre un jardin secret...
À Los Angeles, Sam, jeune chômeur sans perspective, part à la recherche de sa voisine disparue et se découvre un complot délirant au cœur de la ville...
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