Le village d'Ashitaka est attaqué par un sanglier rendu fou par la colère et la douleur. Touché par le sanglier qu'il a tué, Ashitaka est forcé de partir à la recherche du dieu Cerf pour lever la malédiction qui lui gangrène le bras.
Sheeta, jeune adolescente poursuivie par des militaires qui convoitent la pierre magique qu'elle possède, rencontre Pazu, un jeune mécanicien rêvant de devenir pilote. Ensemble, ils décident de se lancer à la recherche d'une légendaire cité volante.
Sur une Terre ravagée par la folie des hommes durant les sept jours de feu, une poignée d'humains survit tant bien que mal. Les survivants attendent le salut de la princesse Nausicaä, capable de communiquer avec tous les êtres vivants.
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