Sheeta, jeune adolescente poursuivie par des militaires qui convoitent la pierre magique qu'elle possède, rencontre Pazu, un jeune mécanicien rêvant de devenir pilote. Ensemble, ils décident de se lancer à la recherche d'une légendaire cité volante.
La sève du monde-arbre Axis s'épuise. Prise de visions, Kaena est persuadée qu'Axis l'appelle à son secours. Jeune fille rebelle, elle brave les tabous de sa tribu et l'autorité du grand prêtre et se lance dans un périlleux voyage jusqu'aux racines d'Axis, aidée par une créature venue d'un autre monde. L'effrayante vérité que Kaena découvrira la laissera profondément changée.
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