Kotoko est une mère célibataire souffrant de graves troubles psychiatriques. Les services sociaux la soupçonnent de maltraitance et confient son bébé à sa soeur. Sa rencontre avec Tanaka, écrivain renommé, va servir d’exutoire à ses fantasmes de violence…

Dans la banlieue de Tokyo, sous le plancher d'une vieille maison, vivent Arrietty et sa famille, des êtres minuscules appelés les Chapardeurs. Ils se cachent des humains, volent en petite quantité le nécessaire, et se méfient des chats et des rats.

Ryu mène une double vie : la nuit elle travaille dans une halle à marées à Tokyo et occasionnellement elle est recrutée comme tueuse à gages. Monsieur Nagara rend responsable du suicide de Midori, sa fille, David, un homme d'origine espagnole, qui tient un commerce de vins à Tokyo. Ishida, un employé de monsieur Nagara qui aimait Midori en silence, engage Ryu pour tuer David...