Assise, 2005 : un troubadour parcours les rues de la ville natale de Saint-François d’Assise, chantant et jouant la chanson de Frère Soleil, ou Chanson des Créatures, écrite par Saint-François durant l’hiver 1224.
Le 25 avril 1974, à Lisbonne, de jeunes capitaines décident de renverser le régime fasciste. Au son de Grândola, une chanson jusque-là interdite, et, dans la liesse, ils prennent le pouvoir avec le soutien d'une population enthousiaste. C'est la "révolution des oeillets" et la fin d'un empire conduit par la dictature.
Julie, actrice française et lusitophone, découvre Lisbonne alors qu'elle doit jouer dans une adaptation des "Lettres portugaises". Elle est fascinée par une religieuse qui vient prier toute les nuits dans une chapelle sur la colline de Graça. Au cours de son séjour la jeune femme fait des rencontres sans lendemain, mais après une nuit où elle parle avec la religieuse, son destin lui apparaît.
Quand Odete confie son désir d'enfant à son fiancé, celui-ci l'abandonne. Le rêve d'Odete devient alors une obsession. Pedro et Rui, deux jeunes garçons, échangent bagues de fiançailles et promesses d'amour. Mais Pedro est victime d'un accident mortel la nuit même. Désormais, Rui se sent perdu, sans espoir ni envie de vivre. Son destin croise étrangement celui d'Odete.
Alice, une petite fille de deux ans, disparaît mystérieusement de la maternelle. Son père se lance à sa recherche. Il visionne et analyse systématiquement les bandes vidéos enregistrées par les caméras de surveillance de Lisbonne. Des milliers de visages d’enfants sont ainsi punaisés sur les murs de son appartement en quête obsessionnelle de celui d’Alice.
Magdalena et Maria, des jumelles, ont été séparées à la naissance. Maria grandit dans un pensionnat de jeunes filles, fugue et finit chanteuse dans les tripots marseillais. Magdalena a été adoptée, elle travaille dans une galerie d'art, dans le Marais, et se passionne pour les faits divers. De leur mère, les jeunes femmes ne conservent qu'une seule trace : une carte postale.
Depuis les années 1940, Manuel a entrepris de découvrir la véritable identité de Christophe Colomb. Dans ses multiples voyages entre le Portugal et les Etats-Unis, toujours accompagné de sa femme, l’autre grande passion de sa vie, il a été le témoin de nombreux changements dans le temps et dans l’espace. Aujourd’hui, il fait un dernier voyage dans la maison qui a vu naître Christophe Colomb...
Mozambique, 1969, un camp militaire pendant la guerre coloniale. Le capitaine Costa entretient une relation secrète avec Vicente, un jeune et bel infirmier. Mais cet amour interdit est difficile à vivre et à préserver au sein de la garnison.
Un chien aboie et gratte à une porte fermée. Une paire d'yeux apparaît derrière un masque noir en caoutchouc. Sergio construit le monde à sa mesure. Il est éboueur à Lisbonne. Dans la solitude de sa pension bon marché, guidé par son désir du sexe des hommes, il trouve, une nuit, le fantôme de ses rêves.
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