1939. Les troupes d'Hitler ont envahi la Pologne et les nazis commencent à persécuter les Juifs. La jeune Irena Gut Opdyke décider de cacher une douzaine de travailleurs juifs dans la cave de la maison de l'officier allemand qui l'emploie...

Accompagné par Riszard Horowitz, photographe et ami de longue date, Roman Polanski déambule dans les rues de Cracovie, ville martyre où il a grandi.

Pour leur lune de miel, Anna et Adam, une jeune couple de parisiens, parents d'un petit Simon, se rendent en Pologne, pays de leurs ancêtres. Tous d'eux d'origine juive, c'est l'occasion d'en savoir un peu plus sur les drames de leurs familles.

Jozef vient voir son père en traitement dans un sanatorium, où le Dr. Gotard entretient une très mystérieuse atmosphère. Dès que l’on y pénètre, on entre dans un monde de fantaisie issu du subconscient.

Wladyslaw Szpilman, brillant pianiste juif polonais, échappe à la déportation. Contraint de vivre au ghetto de Varsovie, il finit par s'échapper et se réfugier dans les ruines de la capitale. Un officier allemand va alors lui permettre de survivre.

"Mes parents sont venus de Pologne en 1947 avec un visa de transit valable huit jours... Ils sont arrivés à Bruxelles... Ils ont souvent déménagé, dans ce même quartier... "Ma Medina: mon royaume", dit ma mère... A 30 ans j'ai pu faire ce film... A partir de sa voix, j'ai recréé des images..." raconte le réalisateur. C'est cette histoire d'exil qu'il raconte ici. Comme un chant de mémoire.

Plus de vingt ans après leur conversation enregistrée pour "Shoah", en 1979, Claude Lanzmann revient vers Yehuda Lerner; à 16 ans, il fut l’un des acteurs de la révolte des Juifs du camp polonais d’extermination de Sobibor. Le 14 octobre 1943, à 16 h, le jeune Yehuda Lerner foudroya d'un coup de hache un officier allemand, lançant le signal de la révolte...